IPA는 공사 창립 2년차인 2006년도를 맞아 보다 활발한 사업 확장과 최적의 수익성*공익성의 조화, 민간자본 유치 등에 관한 투자자문 역할을 수행할 투자자문위원회를 구성해 활동에 들어갔다.
새롭게 구성된 투자자문위원회는 △조용균 변호사(법률 분야) △황효진 회계사(회계 분야) △오정환 신한은행 공기업IB마케팅팀 부부장(금융 분야) △김범중 한국해양수산개발원 부연구위원(기술 분야) 등을 자문위원으로 위촉했다. 이들 자문위원은 법률과 회계, 기술, 금융 분야의 전문가들로서 실질적이고 효율적인 투자자문을 수행할 수 있도록 구성됐다. 투자자문위원장은 박용문 인천항만공사 경영기획본부장이 맡아 앞으로 공사의 사업계획 수립이나 시행중 자문이 필요할 경우 수시로 회의를 소집해 운영하게 된다.